Oblastní charita Třeboň je samostatný právní subjekt a je součástí Diecézní charity České Budějovice a členem Sdružení Česká katolická charita. Úzce spolupracuje se státními subjekty zainteresovanými v sociální práci, zprostředkovává státní dotace, zajišťuje kontakty s ostatními charitativními organizacemi, zprostředkovává humanitární pomoc do tuzemska i do zahraničí. Charita má dlouholetou tradici založenou na dobrovolnické práci, od roku 2001 poskytuje služby profesionálně. Jejím posláním je pomoc člověku v nouzi, jeho začlenění v obtížné životní situaci do společnosti cestou sebepoznání, výchovou k odpovědnosti či vlastním zvládnutím jeho nemoci a bolesti.

Třeboňská charita také provozuje Sociálně terapeutickou dílnu Motýl.